DNA yetmedi, RNA evresi başladı: 40.000 yıllık mamut fosilinden çıkan sürpriz
Antik DNA’nın çıkarılması ve dizilenmesi, soyu tükenmiş birçok tıp hakkındaki anlayışımızı kökten değiştirdi. Fakat yeniden de, DNA’nın bize anlatabildikleri hala epeyce hudutlu. RNA (Ribonükleik Asit) ise hangi genlerin sahiden “açık” olduğunu göstererek, ölen bir hayvanın hayatının son anlarına dair eşi gibisi görülmemiş bir içgörü sunabiliyor. Son keşifler, şaşırtan derecede eski mamut RNA’sının geri kazanılmasıyla tam olarak bunu başardı.
RNA’nın mevtten sonra birkaç saatten fazla hayatta kalamayacağına dair yaygın inanış, uzmanların mamutlar ve öteki antik cinslerde çok ağır RNA aramaları yapmamalarına sebep oluyordu. Lakin Cell mecmuasında Cuma günü yayımlanan yeni bir araştırma, bu varsayımı büsbütün değiştiriyor. Araştırmacılar, Buz Devranı yünlü mamutlarından birinci kere başarılı bir biçimde RNA moleküllerini izole edip diziledi.
Sibirya’nın donmuş topraklarında neredeyse 40.000 yıl boyunca korunmuş mamut dokularından çıkarılan bu RNA dizileri, bugüne kadar elde edilen en eski RNA dizileri oldu. Bu bulgu, RNA’nın meyyit dokularda daha evvel inanıldığından çok daha uzun mühlet hayatta kalabileceğini gösteriyor. Daha da değerlisi, tahliller yünlü mamut biyolojisi ve hayvanların ölmeden evvelki anlarında neler olduğu hakkında daha evvel erişilemeyen ayrıntıları ortaya çıkardı.
Kopenhag Üniversitesi Globe Enstitüsü’nden çalışmanın baş muharriri Emilio Mármol, “Yalnızca DNA ile, genin ne kadar sıkı yahut gevşek paketlendiğine dayanarak en fazla bir genin etkin mi yoksa inaktif mi olduğunu varsayım etmeye çalışabilirsiniz” diyor ce devam ediyor: “Ancak RNA ile, hücrede bulunan RNA transkriptleri biçiminde bu sözün direkt deliline erişebilirsiniz.”
Yuka’nın vefat anına ışık tutmak
Mármol ve meslektaşları, Kuzeydoğu Sibirya’da bulunan donmuş on yünlü mamut örneğinin kas ve derilerinden RNA dizilerini çıkardılar. Yuka ismindeki genç bir mamut örneğinin tahlili, kas kasılması ve gerilim altındaki metabolik düzenlemede kilit rol oynayan proteinleri kodlayan RNA moleküllerini buldu.
Mármol, “Hücrenin ölmekte olduğunu gösteren – yani hücre ölmeden çabucak evvel gen sözünün son anlarını geri sardık – ya da kasta daha evvelce var olan gerilimin bir işareti olabilecek birtakım protein kodlayıcı ve mikroRNA’lar bulduk” diyor.
Bu bulgu, Yuka’nın muhtemelen mağara aslanları üzere yırtıcılardan kaçtığını yansıtıyor olabilir. Lakin Mármol, datalarına dayanarak gerilim belirteçlerinin yırtıcılardan kaçmaktan mı yoksa hücrelerin ölmesinden mi kaynaklandığını kesin olarak ayırt etmenin mümkün olmadığını belirtiyor.
Araştırmacılar ayrıyeten kas metabolizması için hayati kıymet taşıyan kasa has mikroRNA’lar buldu. Bu da antik bir hayvanda gerçek vakitli olarak gen düzenlemesinin gerçekleştiğine dair direkt ispat sunuyor. Dahası, mikroRNA tahlili, bulguların nitekim antik mamutlardan geldiğini doğrulamaya yardımcı oldu.
Özellikle kıymetli bir mikroRNA’nın (Mir-1) birçok dizisi, çoklukla sadece fillerde ve onların yakın akrabalarında bulunan az bir mutasyon içeriyordu. Mármol, mamuttan öbür bu çeşitlerden ek bir kirlenme ispatı bulamadıkları için, bu az mutasyonu taşıyan Mir-1 dizilerinin, bunların gerçek antik RNA molekülleri olduğunun kesin delili olduğuna inandıklarını söylüyor.
Yeni fırsatlar dünyası
Bu bulgular, antik genomik araştırmalar için orijinal bir dünyanın kapılarını açıyor. Mármol, “Çalışmamızın, sadece Buz Zamanı’ndan yahut soyu tükenmiş cinslerden değil, birebir vakitte hem soyu tükenmiş hem de hala var olan organizmaların ortaçağ yahut tarihi kalıntılarındaki RNA’yı keşfetmeye yönelik ilgiyi artırmasını umuyoruz” diyor.
Araştırmacı, gelecekteki çalışmaların, antik cinslerin biyolojisine dair daha eksiksiz bir fotoğraf sağlamak için birleşik DNA, RNA ve protein tahlillerini araştırmayı içerebileceğini belirtiyor. Bu, yalnızca karmaşık organizmaları anlamakla kalmayıp, tıpkı vakitte RNA virüsleri üzere kolay hayat formları için de yararlı olabilir.
Mármol, “Kökenini hala bilmediğimiz birçok geçmiş salgının nedeni RNA virüsleri olabilir” diyor. Geçmiş RNA virüsleri hakkında daha sağlam bir anlayış kazanmanın yalnızca onların evrimini aydınlatmakla kalmayacağını, birebir vakitte gelecekteki salgınları iddia etmemize ve onlarla uğraş etmemize yardımcı olacağını da kelamlarına ekliyor.
Chip Alıntıdır…
